益利来生物有机肥料的功效作用主要是与营养素的来源和有效性（微生物的关键作用）有关。目前，利用益利来生物技术生产的生物有机肥料、生态有机肥料或精制有机肥料在国内外共有十多个品牌（商标），并且已形成系列产品（有通用型和十多种专用型）和产业规模。综合其多年来用户反馈的意见，主要有以下功效：
　　一、 增产：增产是所有农户的愿望。以益利来生物有机肥料作为主施肥，再配施少量化学氮肥（尿素），就能起到令人满意的增产效果，以种植水稻为例，每亩（667㎡）施用益利来生物有机肥料40㎏＋尿素12㎏，与单施化学肥料（复合肥）为对照，在同一品种，同样管理，同样肥料投入成本的前提下，一般增产幅度在20~50%之间，增产显著。
　　 二、 增收：长期以来，增产不能增收的问题困扰着广大农户。下面还是以主要粮食作物水稻为例，许多农户种植水稻习惯大量施用化学肥料，一季水稻经过三个多月的辛勤管理，眼看就要丰收在望，结果一场大雨，一次台风或一次寒露风，就可能造成其严重减产或颗粒无收；但凡使用了益利来生物有机肥料的水稻种植农户，就能体会到益利来生物有机肥料给其带来的增产增收的喜悦。这是因为，益利来生物有机肥料能有效地控制水稻稻秆第一、第二关节生长的短、粗、壮，且能保障水稻稻秆有足够的韧性和弹性，能保障水稻的根系发达，能保障水稻叶片的厚度和硬度以及叶绿素的正常，能保障水稻整齐化一的抽穗和快速的灌浆，早成熟早收成。所以，能有效地提高或增强水稻抗倒伏、抗病害、抗寒能力，达到颗粒饱满，千粒重增加，秕谷率降低（与化肥对照一般秕谷率可降低80%以上）等诸多优点。益利来生物有机肥料不仅在水稻作物上有良好的表现，而且在其他作物（如小麦、油菜、甘蔗、香蕉、花生、棉、茶、土豆以及各种果树和蔬菜等）上的增产增收作用，则更为出色。
　　三、 增效：增效一般泛指增加经济效益、生态效益和社会效益，这是人们最大的愿望，也是我国实施现代生态农业可持续性发展战略目标的终极目的。益利来生物有机肥料虽然称不上是十全十美的，还存在使用初期肥效发挥较缓慢的缺点，这是生物肥料的性质所决定的，因为生物固氮确实需要一个过程。但经采用配施部分化学氮肥的科学施肥方法，以取化学氮肥速效之长，来弥补生物肥料使用初期肥效缓慢之不足。经十多年来的大面积实验，两者配合使用，以生物有机肥料为主，化学氮肥（尿素）为辅（只限于提苗），种植各种粮、油等多种经济作物，均表现出了较突出的经济、生态、社会效益。主要体现在显著提高了肥料的利用率，大幅度降低或减少了化学肥料对土壤、水源、空气的污染，增强了农作物自身的抗病、虫害的能力，减少了农药的使用量，大幅度提高了各种农作物的产量，特别是显著改善和提高了农产品的品质，解决了由于长期使用化学肥料导致的果不香，瓜不甜，菜无味的老大难问题。降解或降低了土壤以及农产品中的化学农药、化学肥料残留，增强了农产品的商品性和商品价值等等。综上所述，益利来生物有机肥料的大力推广和应用，不但能产生较大的经济效益、生态、社会效益，而且还对我国政府实施的“农产品安全工程”和“食品安全工程”以及“饲料安全工程”增加了可操作性和有力保证。
　　四、提高和增加土壤肥力：这也是其最主要的功效之一。具体体现在可以增加土壤中的氮素来源，可以将肥料中以及土壤中难溶性的磷、钾、硅、钙、镁、硫等分解出来，转变为植物能吸收利用的相对化合物（如磷、钾化合物等），使土壤中的各种营养元素供应增加，同时也增加土壤中有机质含量。
　　五、显著提高农产品品质：施用益利来生物有机肥料与施常规化肥对照，其农产品中化学农药、化学肥料残留可下降80%以上，蛋白质，糖份、维生素等成分含量均有不同程度增加，特别是农产品的自然风味较浓烈（该甜的更甜，该苦的更苦，该辣的更辣），且形色美，口感好。尤其是还可延长一些名贵水果蔬菜的采摘期和储藏保质期。是生产有机食品、绿色食品（无公害粮食、水果、蔬菜）的首选肥料。
　　六、有效增强农作物抗病虫害、抗倒伏、抗旱、抗寒能力。施用益利来生物有机肥料的作物，由于其根系发达，粗壮，如水稻、小麦、等作物不会出现倒伏现象，而且病虫害较轻，可以大大减少农药的使用量和使用次数。